Pod biocenozą rozumie się system relacji między organizmami, które mają wspólne terytorium. W systemach mikrobiologicznych stosuje się termin "mikrobiocenoza".
Biocenoza pochwy występuje po urodzeniu dziewczynki. Przy urodzeniu pochwa jest sterylna. Po dniu pojawiają się różne mikroorganizmy. W przyszłości biocenoza pochwy jest tworzona głównie przez bakterie kwasu mlekowego. Pod wpływem estrogenów, uzyskanych przez dziewczynę od matki, w pochwie wytwarza się kwaśny ośrodek. Później dziewczyna i kobieta zaczynają opracowywać własne estrogeny, stymulując istnienie kwaśnego środowiska pochwy. Mikroorganizmy, które wchodzą do pochwy, szybko ulegają depresji przez pałeczki kwasu mlekowego żyjące w najlepszych warunkach dla siebie.
Układ równowagi drobnoustrojów w pochwie może się różnić z różnych przyczyn:
Aby przywrócić równowagę mikroflory, stosuje się probiotyki dopochwowe i eubiotyczne w pochwie. Są to formulacje zawierające pałeczki kwasu mlekowego. Środki są stosowane na tampony pochwowe lub są podawane w postaci czopków dopochwowych.